注册会计师在计划内部控制审计工作时，首要任务是评估重大缺陷风险。

根据教材原文，计划内部控制审计工作的核心步骤包括了解内部控制、评估重大缺陷风险和制定审计计划。其中，了解内部控制是首要步骤，而非直接评估风险。